布里斯托尔大学使用Oracle云基础设施来加速吸烟药物发现
布里斯托大学的科学家发表了研究表明尼古丁如何影响大脑中的受体是如何努力设计吸烟者戒烟的药物的一部分。
他们已经完成了由供应商捐赠的Oracle云基础设施以及实现生命科学的合作,一家基于西雅图的制药公司专注于Cytisinicline的商业化,一种基于植物基生物碱,其具有高结合亲和力的烟碱乙酰胆碱受体人脑。
据美国国家滥用毒品研究所称,大多数吸烟者都希望戒烟,每年都会尝试永久戒烟。然而,只有大约6%的吸烟者能够在任何给定年内退出。吸烟是全世界第二次死亡的第二次原因。
从布里斯托尔研究发出的论文,烟草乙酰胆碱受体家族中信号繁殖的一般机制,于2019年12月在美国化学学会杂志上公布。
其中两位作者来自布里斯托尔的Oracle的云开发中心,菲尔贝茨和Gerardo Viedma Nunez。
阿德里安Mulholland从布里斯托尔大学的计算化学中心是本文的联合主导作者,以及理查德会议,布里斯托尔生物化学学校的高级研究员。
Mulholland每周告诉计算机:“我们的工作表明,尼古丁如何施加对烟碱乙酰胆碱受体的影响。了解这应该有助于我们设计更好的吸烟助剂。“
这项研究由Led Bristol Scients of Bristol Scients涉及其他机构的学者,使用Oracle的云基础设施。研究人员使用了新的计算模拟方法来对尼古丁与烟碱乙酰胆碱受体的亚型相关的生物化学进行450分析,该机制被认为是对药物的高度上瘾性质的负责。
“每个模拟需要八小时才能在单个云节点上运行”Mulholland。“如果我们使用了我们自己的高性能计算设施,它将在五个中拍摄我们在五年内做的90天。
“我们很幸运地在布里斯托尔来拥有相当良好的HPC资源,但Oracle云使我们能够做的是运行一类新的模拟 - '非均衡'模拟,其中有几百个必须并行完成。Oracle Cloud使我们能够在几周内运行它们,而它将每年服用我们。
“要理解为什么尼古丁是如此上瘾,并且开发分子帮助人们戒烟,我们需要了解尼古丁如何影响神经系统。通过利用云计算的力量,我们可以快速观察尼古丁如何施加其在分子水平的影响。这些信息可以为未来的未来药物开发为达到的公司提供新的治疗方法。“
根据达到生命科学的新闻声明,大学和制药公司的甲骨文和布里斯托尔,大学和制定分子和潜在治疗,以基于......吸烟在发育中的戒烟复合,细胞蛋白。
根据该陈述,Cytisinicline是“植物基生物碱,具有高结合亲和力的烟碱乙酰胆碱受体。据信通过减少尼古丁戒断症状的严重程度和减少与吸烟相关的奖励和满意度,通过与大脑中的尼古丁受体相互作用来帮助戒烟。“
根据新闻报表,该药物已在中欧和东欧批准超过二十年的批准,并被“超过2000万人”使用。
本文是2016年最初由EPSRC资助的研究的一个产出,72.4万英镑。
Mulholland表示,能够利用这种科学研究的云计算的美丽在于其能够实现协作。“我是一个伟大的信徒,不同种类的科学家,共同努力获得最佳结果。他说,这并不是关于自己的权利,而是作为产品开发计划的一部分,“他说。
“这有助于告知有什么样的分子可能会被视为潜在药物。能够足够快地进行计算模拟,以便科学家可以快速设计和调整他们的实验,应加速药物开发。我们两年前无法做到这一点。“
该工作汇集了计算化学家,生物化学家和研究软件工程师,共同努力部署尼古丁受体的模拟。
Mulholland也可以应用于这种特定神经科学领域的计算机仿真方法,该方法也可以应用于精神分裂症和阿尔茨海默氏症的研究。